【另一邊的大蛇丸，此刻已經病入膏肓了，需要佐助的身體來續命。
但是佐助在沒有完成復仇之前，可不會將自己的身體交出去，在寫輪眼的絕對壓制下，大蛇丸反而被佐助吞噬。
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三忍之一的大蛇丸，暫時蟄伏了起來。
佐助在大蛇丸的基地之中找到了三個人，水月，重吾和香磷，一同組成蛇小隊。
佐助想要去找鼬復仇，但是卻先遇到了迪達拉和他的搭檔阿飛。
「告訴我，鼬在哪裡？」
認出迪達拉和鼬在同一個組織，佐助立刻發出詢問，想要通過迪達拉知道鼬的位置。
「你就是鼬的弟弟吧，果然和鼬一樣讓人討厭！」
迪達拉看著佐助，這個男人果然和鼬一樣討厭。
面對討厭的佐助，迪達拉並沒有回答，而是直接發動了攻擊。
C1，C2，C3，C4，迪達拉的爆炸物層出不窮，更是有著極為強大的破壞力。
要不是佐助的雷遁克制迪達拉的爆炸物，恐怕根本活不下來。
「讓你看看我最後的藝術！」
氣急敗壞的迪達拉使用了自爆，一個巨大的人形光團出現，緊跟著轟然爆炸。
身體已經殘破的佐助無法跑出爆炸範圍，但是卻使用逆通靈之術，用萬蛇的身體逃過一劫。
佐助沒有放棄尋找鼬的身影。
而在木葉之中，自來也潛入了雨隱村，尋找曉組織的蹤跡。
在這裡自來也找到了曉組織的首領，六道佩恩。
在鏖戰之中自來也死去，但是在臨死之前，卻也將佩恩的情報送了出去。
佐助找到了鼬，兩兄弟之間爆發了激烈的戰鬥，鼬也告訴了佐助很多關於寫輪眼的情報。
比如寫輪眼的晉級需要情感的刺激，比如三勾玉之後是萬花筒寫輪眼，永恆萬花筒寫輪眼。
想要晉升永恆，就需要兄弟的眼睛，在鼬的口中，這也就是他留下佐助的原因。
兩兄弟的戰鬥越來越激烈，幻術，體術，忍術都在交替使用。
從房間內打到了屋外。
「麒麟！」
佐助藉助火遁凝聚出來的雷雲，使用了麒麟這樣的新忍術，逼出了鼬的須佐能乎。
紅色的須佐能乎保護著鼬，而佐助的身體因為查克拉的虧空，被蟄伏的大蛇丸占據。
大蛇丸使用八岐之術和鼬進行對戰，不過這種忍術和須佐能乎這樣的終極瞳術比起來，還是不夠看。
大蛇丸剛剛出來沒多久，就被鼬給封印了，就連殘軀也被天照之火消滅。
鼬死後，佐助被阿飛給帶了回去，講述了關於宇智波一族的事情。
宇智波一族準備發動政變，鼬擔心整個木葉會被拖入戰爭之中，在木葉高層的逼迫之下，無奈的選擇了殺死全族的任務。
而之所以會留下佐助，就是為了讓佐助在未來殺死自己，成為消滅木葉叛忍的英雄。
還可以用自己的眼睛給佐助升級到永恆萬花筒。
到時候佐助就那能重現宇智波的榮光。
知曉了真相之後，佐助開啟了萬花筒，同時決定向木葉復仇，他加入曉組織，前去抓捕尾獸。
第一個目標就是八尾奇拉比。
在差點團滅的情況下，佐助終於是抓住了八尾。
木葉村中，鳴人破解了自來也留下的信息，為了對抗佩恩，鳴人去到了妙木山，修行仙人之術。
就在鳴人修煉的時候，佩恩襲擊了木葉。
「超·神羅天征！」
天道佩恩一個大招，將整個木葉村夷為平地。
「快回來！鳴人！」
小櫻發出痛苦的嘶吼，鳴人終於從妙木山回來。
面對六道佩恩，鳴人霸氣登場，一拳將修羅道打碎，仙法·螺旋手裏劍能夠離開手掌飛出去，消滅了一隻佩恩。
但是鳴人的強悍也只是在天道佩恩恢復之前，天道佩恩恢復之後，神羅天征和萬象天引讓鳴人難以應對。
鳴人爆發出大量的尾獸之力，自身甚至長出了四條尾獸尾巴。
面對尾獸外衣越來越強，尾巴越來越多的鳴人，佩恩也打的非常吃力。
最後使用地爆天星短暫了封印了鳴人。
即便是被地爆天星壓制，鳴人還是繼續爆發尾獸之力，爆發了八根尾巴之後，九尾甚至就要突破地爆天星了。
好在水門的後手發揮作用，查克拉凝聚成人形出現在鳴人的面前，告訴了鳴人他的身份。
同時也鼓勵鳴人一番，重新給鳴人布置了封印。
經過九尾這樣強大的破壞之力，地爆天星被徹底摧毀。
鳴人再次和佩恩戰鬥，這一次鳴人憑藉著仙人模式的感應能力，找到了佩恩的本體，長門的所在之地。
鳴人找到了長門，一番嘴遁之後，竟然說服了長門，讓長門使用了輪迴天生之術，將死去的所有人都復活了。
這也太離譜了。
不過打敗了佩恩，解救了木葉的鳴人成為了木葉的英雄，受到了所有人的尊敬。
因為曉組織的活動，整個忍界都已經察覺到了危險，其它忍村的影也來到了木葉，想要舉行五影會談。
但是綱手重傷沒有甦醒，木葉推舉團藏暫代火影之位，參加五影會談。
佐助也順著五影會談而來尋找團藏報仇。
不過佐助還是太年輕了，面對五影，差點被打死，好在阿飛及時出現，救下了佐助。
而且還說出了曉組織或者說自己的目標，那就是利用尾獸的力量，施展無限月讀，讓整個忍界的人都陷入幻術之中，以此來實現和平。
而五影當然不會認同這個計劃，阿飛也沒有慣著他們，當場宣布第四次忍界大戰開啟。
宣布之後，阿飛帶著佐助去找到了團藏，雖然有著一手臂的復活幣，但是在面對真正的寫輪眼的時候，還是被耗光了。
佐助也在這一場的戰鬥之中熟悉了萬花筒的使用方式，須佐能乎也開啟了。
不過這一次攻擊差點對佐助的眼睛消耗過大，已經接近失明了，他必須要去換上鼬的眼睛才行。
第四次忍界大戰開始了，無論是曉組織還是五影都在不斷的提升戰力。
鳴人和奇拉比學習怎麼控制尾獸的力量，五大忍村在集結人手。
阿飛和藥師兜聯合，除了白絕之外，還有著穢土轉生大軍。】