X平行世界.
大海中某一片小島.
小智一行人受到超夢邀請來到了一個未知洞穴，來尋找全身漆黑的神秘生物.
「這裡好黑呀~總感覺陰森森的，我們還要走到什麼時候啊？」小光雙手摟著身體說道。
「應該很快就到了~按照超夢給我的地圖來看，它應該在洞窟最深處等待著我們。」小智回答道。
小智一行人很快便來到了洞穴深處與等待已久的超夢會合。
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「超夢不好意思讓你久等了~」小智抱歉的說道。
「沒事的~你們來了就好。」超夢回答道。
小光看著眼前陌生的寶可夢，拿出寶可夢圖鑑掃描：「沒有任何資料，是一隻未發現的寶可夢。」
「啊咧？居然沒有資料？」小光驚訝道。
「因為超夢是火箭隊偷偷製造出來的寶可夢，所以寶可夢圖鑑中並沒有和它相關的資料。」小智解釋道。
「原來是這樣啊~」小光恍然大悟道。
「這次我讓你們來是為了之前消滅那隻全身漆黑的寶可夢，我一路追尋它來到這個神秘洞窟，為了以防萬一我就讓你們來搭把手。」
「雖說它已經被我打成重傷了，但是它的逃跑功夫一流，為了防止出現意外，希望你們將洞口守住不要讓它逃出去。」超夢將這次目的說了出來。
「沒問題~你就放心交給我們吧。」小智拍著胸脯保證道。
「有你的保證，我很放心~」超夢微笑道。
隨後超夢帶領著小智一行人來到了暗黑寶可夢的所在地,只見一隻受傷的黑色炎帝趴在一個小型洞穴中休息.
正在睡覺的暗黑炎帝睜開了雙眼，看了一眼不遠處的超夢開口說道：「超夢你這傢伙打算趕盡殺絕嗎？」
「對於你這種濫殺無辜的寶可夢死有餘辜！」超夢回答道。
「切~還真的是聖母心。」暗黑炎帝很不屑的說道。
「多說無益~」超夢並不打算繼續和暗黑炎帝和廢話了，直接從右手掌心凝聚出一個藍色的能量球甩了出去。
小智一行人見狀各自釋放出寶可夢戒備，防止暗黑炎帝逃出洞穴.
「吼！」暗黑炎帝見狀輕輕一跳便避開了波飛彈，反手就噴出一道漆黑的火焰.
超夢見狀製造出一面光牆，直接將漆黑的火焰給抵消掉.
緊接著超夢抬起右手輕輕一握，與此同時就好像有一隻無形的巨手將暗黑炎帝捏住.
暗黑炎帝掙扎無果後，便對超夢笑道：「暗黑創造者會再次降臨到寶可夢世界的，到時候將你們這些傢伙全部變為我們的傀儡。」
緊接著暗黑炎帝身體如同氣球一般不停的變大.
「糟糕！小智你們快跑！它要自爆了！」超夢急忙的說道。
小智幾人聞言，立馬轉身就跑.
轟~
可惜小智幾人跑的還是太慢了，暗黑炎帝爆炸形成一個巨大的蘑菇雲，爆炸的衝擊波將小智幾人吹飛到海中.
「可惡~居然被那傢伙陰了！」
一隻人形的寶可夢罵罵咧咧的衝出蘑菇雲，並在海中尋找著小智等人
.
真新鎮大木博士研究所.
「小智你怎麼會傷成這樣子？」大木博士皺著眉頭看著眼前被繃帶綁成如同木乃一般的小智。
在小島爆炸的那一刻，倒霉的小智被突如其來的巨大岩石砸中身體導致多處骨折，反而小光和小剛則是好多了只是擦破了一些皮.
「這都怪我~我沒有保護好小智。」超夢嘆息道。
「超夢這並不是你的錯~誰都不知道暗黑寶可夢居然會自爆。」小智安慰道。
「可是明天就開始鈴蘭大會冠軍爭奪賽了，你這副模樣該怎麼如何參賽啊。」小剛有些無奈的說道。
「事到如今也只能放棄比賽了，畢竟就小智這個傷勢至少得一個月才能恢復.」大木博士無奈的說道。
小智聞言心有不甘，畢竟自己好不容易打到總決賽了，結果在比賽的前一天受到如此嚴重的傷勢.
「要是有人能替我參加總決賽就好了！」小智不甘心的喃喃道。
小智話聲剛落，小智身上的口袋發出耀眼的光芒，接著一塊七彩水晶從小智的口袋中鑽出來並浮現在半空中.
「這是我之前撿來的那塊水晶？」小智看著漂浮在空中的七彩水晶喃喃道。
H平行世界
真新鎮小智臥室中，一個黑洞出現在小智床鋪正上方.
睡的正香的小智和皮卡丘被黑洞強力的吸力吸了進去
.
X平行世界.
真新鎮大木博士研究所.
兩道黑影從黑洞中被丟了出來，隨後黑洞便消失不見，七彩水晶也變成灰塵.
「哎呦~痛~痛~痛~」
「皮卡~」
被黑洞丟出來的人影正是H平行世界的小智和皮卡丘.
「小智？」一道非常熟悉且驚訝的聲音在小智H耳邊響起。
PS：為了方便分辨每一個平行世界的小智，我會在小智後方加一個平們世界的編號。
小智H略感疑惑的抬頭，循著聲音的方向望去.只見站在離自己不遠處的大木博士、小剛、花子媽媽以及一位陌生的女孩和一隻從沒見過的人形寶可夢驚訝的看著自己.
「突然又出現了一位小智？」陌生女孩驚訝道。
「大木博士、媽媽、小剛你們怎麼在這裡？我剛才不是在睡覺嗎？」小智H有些迷惑的問道。
『小智你快看！』小剛他們還沒有回話，就被皮卡丘H的聲音打斷了。
小智H循著皮卡丘H指的方向望去 只見不遠處的床上躺著一位與小智一模一樣的少年，而位少年的身邊也有一隻皮卡丘.
「為什麼這裡會出現一個我？」小智H有些疑惑道。
「難道我來到另一個平行世界了嗎？」小智H很快就反應過來了。
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